Dario, se me hace raro que uses javascript puro para poner
this.classList.toggle("checked");
y que luego cuando tienes que
poner el mismo comportamiento cuando pulsas en los enlaces, que pongas jquery y además no imites el codigo de arriba si no que pones
$('.hamburg').toggle();
Intenta imitar el comportamiento, y si no, ya que quieres el mismo comportamiento al pulsar en el enlace que cuando haces click en el menú,
imita un click en el menú para que haga su logica sin repetirla. —
lois6b ♦ 24 secs ago