1) клонируешь в соседние директории исходники ffmpeg и ffmpeg-opengl
2) добавляешь в директорию libavfilter симлинк на vf_gearstitch.c
3) применяешь патч FFmpeg.diff, который добавит код, который регистрирует фильтр
4) выполняешь команду configure
Если команда провалилась, значит скорее всего не хватает каких-то пакетов. Найди в логе, каких пакетов не хватает, установи их, повтори шаг 4
5) Собираешь командой make -j 8
не рекомендую делать make install, потому что make попытается установить ffmpeg в /usr, а /usr это место для пакетов, который ставятся пакетным менеджером